菱塘是江蘇省高郵市惟一的少數民族鄉，居民多為回民。被列為“省級文物保護單位”的菱塘清真寺位于菱塘回族鄉北部的清真村，而不是鄉政府所在地的那座雄偉高大的清真寺。
　　據記載，清真村的清真寺，是由傳教士薛琦于清朝道光二十四年（1844年）所建。原占地面積3500平方米，呈前后三進、兩廂三院。寺前有照壁、寺后有花園。寺內建筑有前殿、大殿、窯殿、水房、南北廂房、殯具室等20多間。現存主要建筑有關殿、大殿和四方亭閣（窯殿）。窯殿建筑巨翼重檐，古樸典雅，具有濃郁的民族風格。窯殿西北側有棵300余年的參天銀杏大樹，在其西南側有棵百年金桂。兩棵古樹與窯殿遙相呼應，互為一體，甚為壯觀，為寺院增色不少。整個寺院結構嚴謹、布局整齊。據說，為當時蘇北地區鄉村罕見的大寺院。這座寺院雖然建筑歷史才160年左右，但已分別在清朝光緒十年、民國十年和1995年進行過3次大規模的修繕。特別是10年前的翻修，工程量最大，修復了前殿、大殿，整修了窯殿，復原了清真寺石刻、復建了水房和殯具室，改建了五道花墻等建筑，在保持原汁原味、原有風貌的基礎上，基本恢復了原有清真寺的規模。
    隨著近年來菱塘回族鄉經濟的騰飛，目前，這座清真寺已成為江蘇、安徽等鄰近縣市穆斯林活動中心。日常除了每星期五進行正常的禮拜外，每逢伊斯蘭教的古爾邦節、開齋節、圣紀節等重大節日，都會有數千名穆斯林前來參加宗教活動。原國務委員、國家民委主任司馬義·艾買提和夫人，海灣5國駐華大使和夫人以及海外賓朋曾來到該寺院視察或進行宗教活動。
    2006年，該寺被公布為江蘇省文物保護單位。
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